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从事医学科技写作的过程，就是有目的的、有计划的复杂思维过程。医刊汇编译认为，无论是选择主题、收集材料，还是安排结构、运用语言等各个写作环节，都是人脑积极思维活动的结果。写作主体的思维方法在写作过程中都起着十分重要的作用，直接决定着作品的质量和水平。因此，为了有利于提高医学科技写作的能力和水平，就有必要了解思维方法的作用。
首先，医学科技写作通过收集材料、医学实验、临床观察等实践活动，用感观接触外部的各种事物，接受各种信息，这些外部的事物和信息，通过神经传到人的大脑，形成一定的感觉以及由这种感觉形成的对客观对象的印象，这就是感性认识阶段。这时所认识的是事物的现象、各个层面和事物的外部联系。而应用不同的思维方法进行思维加工，产生认识上的飞跃，形成写作的思路和提纲，进而使之成为视觉化、物质化的语言文字，产生新观点、新方法、新理论……其结果就形成了事物的本质、规律和内部联系，这就是认识的理性阶段。
其次，医学科技写作是富于创造性的高级思维活动，常常需要思维空间的广阔性、思维联系的整体性、思维过程的连动性和思维效果的创优性，因而要善于综合运用或交替运用多种思维方法。比如：在选题时，应侧重于运用发散思维和超前思维的方法，充分利用其开放性和前瞻性的特点，拓展思维视野，以突破传统的和定型的医学理论框架的约束，突破本学科和特定研究对象领域的限制，捕捉富于创新且具有较高学术价值的选题，从而收到“登山千条路，同揽一月高”的效果。
在收集材料时，应着重运用集中思维和逻辑思维的方法，尽可能收集更多的、新颖的能服务于主题的材料，以符合主题的要求为前提，按逻辑思维规律，经分析、鉴别和比较，选择与主题相统一的能充分、鲜明、有力地表现主题的材料，以便为写出具有独到见解、富有新意的作品打下良好基础。
在安排结构时，则主要运用逻辑思维的方法。结构是医学科技作品的骨骼，结构中的逻辑关系，体现在层次清楚、详略得当、前后照应和过渡自然等方面。其中层次清楚，表现在文章中使用的材料和观点，其相互之间的并列、承接、转折、因果、主从等各种关系有一种紧密的内在联系，各层次的内容相互衔接、循序深入，前一层意思要能引出后一层意思，后一层意思又是前一层意思的必然要求与必然发展，这样的篇章结构，很自然其逻辑性就很强。运用逻辑思维的方法，可帮助写作主体组织成一个条理清晰、段落分明、内容连贯、完整统一的篇章结构，达到形式与内容的完美结合。
在语言表达时，既要注重运用逻辑思维，又要适当运用形象思维。无论什么类型的医学科技文体，都要求语言准确、鲜明、生动。鲜明与生动离不开准确，而准确又依赖于概念明确、判断恰当与推理符合逻辑，将逻辑思维和形象思维有机结合、恰当运用，可增强语言表达的准确性、鲜明性，而且更加生动活泼和新颖。
医学科技写作主体的思维方法直接决定着写作作品的质量和水平。因此，要把所探索和解决的问题表述得清楚、准确、科学，又具有独特的新意，就要正确地运用思维方法并遵循思维的规律，对获取的材料进行思维加工。这就要求写作的主体要通过认真学习和积累思维科学的基本知识，坚持独立思考，自觉地有意识地进行思维训练，各种思维方法就会常用常新，愈用愈活，其思维能力就会在不知不觉中得到提高。
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