楼主: zhangruyang
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[问答] 多水平模型,如何获取各水平的方差 [推广有奖]

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楼主
zhangruyang 发表于 2011-4-15 11:33:10 |AI写论文

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利用多水平模型,代码如下:
                #Step6 利用Mixed Effects Model探索有统计学意义的SNP
                lm<-lmer(fev1a~comb[,c(2)]+time+age+height+weight+basemill+atopy2b+homesm+parentax+newhire+pastexp+(1|index),comb)
                tValue<-coef(summary(lm))[2,3]

随机效应结果如下:
Random effects:
Groups   Name        Variance Std.Dev.
index    (Intercept) 80285    283.35  
Residual             10585    102.88  
Number of obs: 1173, groups: index, 415

查阅帮助后得到可以使用VarCorr(lm)。但是得到结果令人迷惑:

$index
            (Intercept)
(Intercept)    80284.65
attr(,"stddev")
(Intercept)
   283.3455
attr(,"correlation")
            (Intercept)
(Intercept)           1

attr(,"sc")
[1] 102.8819


2水平的方差可以发现。1水平的方差呢?
我的目的是将1、2水平的方差提取出来。
请高手指点迷津……
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关键词:多水平模型 多水平 effects Effect model 方差 模型 水平 多水平 不同水平

沙发
offandon 发表于 2011-4-15 13:50:12
软件自然就会帮你分析。。。。。

藤椅
zhangruyang 发表于 2011-4-15 14:02:42
我是想提取各个水平的方差。不知道您有何高招。 2# offandon

板凳
zhangruyang 发表于 2011-4-15 18:07:20
没有人会吗?

报纸
zhangruyang 发表于 2011-4-18 18:56:39
可能我的问题太简单了……但是为什么无人问津?
难道我的问题很复杂……求人不如求己!

无意间发现了正解
diag(VarCorr(lm)$index)
attr(VarCorr(lm),"sc")

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