楼主: Well21
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[学习分享] Bland-Altman一致性评估学习 [推广有奖]

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最近一段时间一直在研究Bland-Altman作图的SAS实现方法,阅读了一些文献和SAS help,拿出来和大家分享一下。
Bland-Altman方法多用于评价测试方法与金标准方法的一致性情况,主要用于连续性变量的测定,而对于分类变量,则多采用敏感度、特异度、准确度、Kappa等参数进行评估。
其基本思路为:利用原始数据的均值和两种检测的差值(或比值),分别以均值为横轴,差值为纵轴做散点图,计算差值的均数和差值的95%一致性界限(均数±2SD,也有文献使用均数±1.96SD)。
在SAS中,没有相应的程序直接绘制Bland-Altman图,有大神曾编制了Macro宏程序来实现,相应的PDF说明我贴在了附件里。该方法非传统的Bland-Altman图,有需要的道友可自行尝试。 BlandAltman.zip (544.39 KB, 需要: 2 个论坛币) 本附件包括:
  • ba.sas7bdat
  • BlandA_Fernandez 2009 WUSS.pdf
  • BlandAltman.Mac
  • BlandAltman_maccall.sas

更一般的方法为使用PROC SGPLOT程序来绘制该图像,具体代码见楼下。
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沙发
Well21 发表于 2023-5-6 22:52:13 |只看作者 |坛友微信交流群
  1. data diffs;
  2. diff = wn12-pn12; #此处计算两连续变量差值
  3. mean = (wn12+pn12)/2; #此处计算两连续变量均值
  4. run;
  5. proc sql noprint; #获得95%置信区间数值
  6. select mean(diff) - 2*std(diff), mean(diff)+2*std(diff)
  7. into :lower, :upper
  8. from diffs;
  9. quit;
  10. proc sgplot data = diffs; #绘制B-A图,包括散点、上下95%区间线、参考线y=0及loess拟合曲线
  11. scatter x = mean y = diff / MARKERATTRS = (color = black symbol = CircleFilled);
  12. refline &upper &lower / lineattrs = (pattern = 2);
  13. refline 0 / lineattrs = (thickness = 2);
  14. loess x = mean y = diff / CLM CLMTRANSPARENCY = 0.7;
  15. title 'Bland-Altman Plot';
  16. xaxis label = "Mean of Measurements";
  17. yaxis label = "Difference between Devices";
  18. run;
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