有向无环图（DAG)程序及操作学习分享

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发现有向无环图的介绍帖比较少，本人也是才接触，稍微有点心得，分享共同学习。
附件包括：DAG压缩文件中有一个操作手册，当年tetrad的文章（包含了详细的计量学解释），一篇国内的文章对DAG进行了解释；tetrad软件。 tetrad软件需要JAVA程序运行，去网上下载一个即可。下载安装完成，点击tetrad软件假如运行出现错误，打开控制面板=>程序=>JAVA=>安全，将安全级别调至 中 再运行即可。
打开界面应该如图所示，
点击data, 建立一个data box(默认名：data 1)，直接点ok(data wrapper)，需要导入数据的话直接file=>load data， 试过之后一般text文本文档导入效果最好（如图），点击load，如果显示“Data set loaded!”则表示导入成功（如图）。再建立一个search，点击search图标，选择PC（一般都是内置的PC算法当然别的算法也可以选别的），通过左栏的剪头将data和search建立关联，打开search，就能得到环形图（如图，图中所示只是举例数据，所以出现了环形，可以通过施加约束或者去掉线再度关联Search和DAG，dag建立方法手册中有）。
个人摸索，如有不对的地方还请纠正。

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关键词：DAG search Tetrad Loaded java程序 在线

tetrad 4.3 在论坛上已经存在，无法上传，需要的朋友自己搜一下吧，另外图上传的时候没注意顺序，倒过来看。

非常感谢

怎么做施加约束啊？在操作手册里似乎没找着？求楼主指教啊~~

最近正在做论文，要用这个模型，感谢楼主！

想请问下楼主，输入的数据是原始数据还是输入扰动相关系数矩阵呢？看到好多论文都是求了残差的相关系数矩阵，然后以此为基础做的DAG，搞不太明白。

cx1991111 发表于 2015-1-7 16:57
想请问下楼主，输入的数据是原始数据还是输入扰动相关系数矩阵呢？看到好多论文都是求了残差的相关系数矩阵 ...

残差的相关系数矩阵可以用来展示相关关系，但残差的量纲就是数据本身，直接用原始数据就可以，其计算原理就是使用方差比D(Y)/D(X)，这里方差比近似看成残差比（要加入自由度，可以翻翻统计方面的书籍），假设Y=A+BX+E，A是截距，E是随机扰动项，假设相互独立，那么D(Y)=D(A)+B^2*D(X)+D(E)=B^2*D(X)+theta^2，theta^2是随机扰动项的方差，假如Y=A+BX+E成立，也就表明X是Y的原因，于是只要D(Y)/D(X)在一定显著水平上满足DAG条件就可以得出因果关系，大概就是这样，我也是自己研究，不对的地方还请指正。。

geninne 发表于 2014-12-30 11:02
怎么做施加约束啊？在操作手册里似乎没找着？求楼主指教啊~~

施加什么约束啊？DAG不需要施加约束啊

pzlzz 发表于 2015-1-15 21:08
残差的相关系数矩阵可以用来展示相关关系，但残差的量纲就是数据本身，直接用原始数据就可以，其计算原理 ...

明白了。非常感谢楼主，最近也是在做这方面的论文。由于我数据量只有100多所以取得P值为0.2，图是做出来了，就是不知道怎么得到各关系的P,t之类的值，不知道楼主知道怎么弄出来不？

cx1991111 发表于 2015-1-16 14:23
明白了。非常感谢楼主，最近也是在做这方面的论文。由于我数据量只有100多所以取得P值为0.2，图是做出来了 ...

execute下面有一个cal stats按钮，点一下，会给出p值和卡方统计量，由于PC算法构造的是卡方统计量，因此没有t值的，卡方英文表达式好像是chi-square什么的，点下看看就ok了