楼主: 名字不很酷
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[问答] R语言 Cox回归 数据分层 [推广有奖]

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名字不很酷 发表于 2016-3-29 20:23:10 |AI写论文

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各位大神,想问下Cox回归中设定了分层变量(level=2),也就是说会将数据按照不同的两层进行拟合,coxph()得出的其他变量的参数应该有两套啊,为什么只有一套呢?代码和输出结果如下:
>cox1<-coxph(Surv(days,status==1)~log(thick)+sex+strata(ulc))#这是模型,包含了一个分层变量ulc;
> summary(cox1) Call:coxph(formula = Surv(days, status == 1) ~ log(thick) + sex +     strata(ulc))  n= 205, number of events= 57              coef exp(coef) se(coef)     z Pr(>|z|)   log(thick) 0.5599    1.7505   0.1784 3.139   0.0017 **sex        0.3600    1.4333   0.2702 1.332   0.1828 #sex和log(thick)的系数估计值只一个,是针对哪一层的呢---Signif. codes:  0 ‘***’ 0.001 ‘**’ 0.01 ‘*’ 0.05 ‘.’ 0.1 ‘ ’ 1           exp(coef) exp(-coef) lower .95 upper .95log(thick)     1.750     0.5713     1.234     2.483sex            1.433     0.6977     0.844     2.434Concordance= 0.673  (se = 0.058 )Rsquare= 0.063   (max possible= 0.9 )Likelihood ratio test= 13.3  on 2 df,   p=0.001296Wald test            = 12.88  on 2 df,   p=0.001598Score (logrank) test = 12.98  on 2 df,   p=0.00152
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关键词:Cox R语言 concordance Likelihood possible number events status

沙发
seanfang1992 发表于 2016-6-23 20:10:08
我刚刚也做了,我觉得他是按ulc分层后,ulc各个曾经做的分析?求高手指点咯

藤椅
xjh_109 发表于 2016-8-31 09:39:27
我也弄清楚了,确实是针对strata(ulc)中的ulc分类进行的,我修改了下,是这样进行的!
cox1<-coxph(Surv(days,status==1)~log(thick)+sex,data=mydata[ mydata$gender==1 ,])
这样的结果是针对gender赋值为1的分组进行HR分析!

板凳
立妍Z 发表于 2021-5-24 10:56:11
请问,楼主解决了嘛,我现在也有同样的疑惑

报纸
jcx350 发表于 2021-5-30 17:44:51
立妍Z 发表于 2021-5-24 10:56
请问,楼主解决了嘛,我现在也有同样的疑惑
可以看下,分层cox回归的定义,里面有个假设,是假设所有层的系数(即beta)的值是相等的,因此,这里算出来的系数并不是看哪一层的。可以说是,所有层的系数是相等的。这里分层cox回归主要是假设,不同层之间的基。准危险函数是不同的(即违背了风险成比例这一个假设)。希望可以对你们有所帮助、

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