t检验与Bonferroni correction

多次两两比较时，用Bonferroni矫正应该是P/n，P一般为0.05，n为多次比较次数。


但最近看到三篇文献中统计分析描述如下：


【1】Differences between diagnostic groups were determined by ANOVA as well as Student's t-test with subsequent Bonferroni correction, with P<0.05 considered significant.

【2】two-tailed unequal variance t-test followed by Bonferroni’s correction was used.


【3】Two-sample unequal variance t-test followed by Bonferroni’s correction was used to calculate whether the observed differences in growth were statistically significant. For all experiments, a P-value <0.05 was considered significant.



那么，P值为什么还是在用0.05呢？

是啊  你把 p x 3 （因為共有三個 pairewise comparisons）就是那欄「調整顯著性」的數值

ps. 我可以拿你懸賞的 3 個论坛币嗎  有急用 XD

bonferronni's correction is used for corrected number of the degree freedom.

P value is the probability of error I. So you always use p<.05 or .01 for significant analysis.

steven.chenjing 发表于 2016-6-8 04:44
bonferronni's correction is used for corrected number of the degree freedom.

P value is the proba ...

多谢回答~能解释的详细一些么

因為  寫 paper 的人不是真的那麼懂  他是根據統計報表來讀來寫  XD

理論上  如您講的  "Bonferroni矫正应该是P/n，P一般为0.05，n为多次比较次数"  矯正的是 critical level
也就是說  每個事後檢定的 p 都要跟這個新的 critical level 比
--> p   vs.   .05/n

但是  以 spss 報表來說  outputs 上 bonferroni 的 p 是「未矯正的 p x n」
所以使用者可以直接拿報表上 bonferroni 的 p 來跟 .05 比
--> p x n   vs.   .05

看到上面兩個式子了嗎  他們是一樣的

所以啊  一般使用者只需要稟著 .05 的標準  去讀 spss 報表&判斷 bonferroni 是不是顯著  
因此  你可以相信你唸的那期刊論文所報告的結果 :)
但是  原作者那樣寫其實沒有完全正確（因為  理論上 bonferroni 的邏輯是 critical value = .05/n ）

ps. 那我們怎麼知道 spss 的 bonferroni p 是未矯正的 p x n 呢
LSD 事後檢定就是未矯正 familywise alpha （i.e., .05)  
LSD 的 p 值跟你任選兩組然後做一個 t-test 的 p 值是一樣的
你把  LSD 的 p 拿來乘以你總共有的兩兩相比的比較數  就會是報表上的 bonferroni p

希望  這樣有清楚 ^_^

BearDream 发表于 2016-6-10 06:24
因為  寫 paper 的人不是真的那麼懂  他是根據統計報表來讀來寫  XD

理論上  如您講的  "Bonferroni矫正 ...

我明白了，非常感谢！我想到了以前遇到过个一个问题，还想请教一下，多谢！

图中的调整显著性是指Bonferroni矫正过的么？

多谢大家的回答！

BearDream 发表于 2016-6-7 21:23
是啊  你把 p x 3 （因為共有三個 pairewise comparisons）就是那欄「調整顯著性」的數值

ps. 我可以拿你 ...

非常抱歉，我刚看到~已经采纳为最佳答案。可以加为好友么

meton1987 发表于 2016-6-13 16:05
非常抱歉，我刚看到~已经采纳为最佳答案。可以加为好友么

謝謝论坛币
可以啊  我是新人  多多關照