楼主: yijiaobani
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[学习分享] asreml-r summer school 北京林业大学 [推广有奖]

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yijiaobani 发表于 2017-6-6 19:13:53 |AI写论文

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遗传参数BLUP、GBLUP以及GS的Summer School



在育种中,准确的评估遗传参数是育种效率提高的关键,混合线性模型可以结合各类信息(年份、地点、场、系谱)评估遗传力、育种值、重复力以及遗传相关,并在国际上得到了广泛的应用,成为遗传参数评估的核心方法。另一方面,随着基因组时代的到来,大量的SNP能更加准确的评估各类遗传参数,基于SNP估计的GBLUP,以及**全基因组选择(GS)**在动植物育种中发挥了重要作用。

ASReml是拟合线性混合模型的强大遗传数据分析软件,由NSW Department of Primary Industries(澳大利亚新南威尔士州第一产业部)的Arthur Gilmour博士开发,相比于其它软件,ASReml可利用灵活的混合线性模型和广义线性模型来处理大规模的数据,实现大数据高效、快速的分析。即便在群体规模大、群体结构复杂和观测数据不平衡的条件下,也可以获得较精确的育种值。目前,ASReml软件已在世界范围内广泛地应用于林业、渔业、畜牧、作物、医学等众多领域的研究,并辅助科研人员在相关领域知名期刊发表了大量文章。

第一天:2017年7月24日

  • Introduction to ASReml-W and ASReml-R(ASReml-W和ASReml-R介绍)
  • Introduction to Linear Mixed Models(混合线性模型介绍)
  • Breeding Theory(数量遗传育种理论)

第二天:2017年7月25日

  • Genetic Models(遗传模型)
  • Multivariate Analysis(多性状分析)

第三天:2017年7月26日

  • Spatial Analysis(空间分析)
  • Multi-environment Analysis(多环境数据分析)

第四天:2017年7月27日

  • SNP Association Tests(SNP关联分析)
  • GWAS (全基因组关联分析)

第五天:2017年7月28日

  • Introduction to GBLUP(GBLUP介绍)
  • GBLUP in ASReml-R and ASReml-W(GBLUP在ASReml-R和ASReml-W中的实现)

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