主成分分析中各指标的贡献率超过多少才重要

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在factoextra包中对贡献率有一个绘图。图中有参考线，高于此线的认为变量是显著的，有没有哪位知道这个线的值是多少，随着变量的多少这个值是不同的。

1. library(factoextra)
   
2.     library(FactoMineR)
   
3.     df <- decathlon2[1:23, 1:10]
   
4.     res.pca <- PCA(df,  graph = FALSE)
   
5.     fviz_contrib(res.pca, choice = "var", axes = 1, top = 10)

复制代码

包的帮助中说了这个参考线，但没说这个线对应的值是多少：
A reference dashed line is also shown on the barplot. This reference line corresponds to the expected value if the contribution where uniform. For a given dimension, any row/column with a contribution above the reference line could be considered as important in contributing to the dimension.

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在函数的原文件中找到了答案。

是100/length(contrib)
也就是100除以变量个数

感觉这个并没有一定道理，相当于强行规定只有本征值大于100的才视为重要，然而实际数据并不见得要满足这一条件～

不对，我再看一下～

等价于本征值大于1

假定有k个变量，主成分分析中选择主成分个数一般有两个标准：
一是单个主成分的贡献率大于1/k，也就是说变换后，单个主成分所含信息不小于变换之前的每个变量；
你刚好有10个变量，所有需要贡献率大于10%；
二是累积贡献率大于80%。

函数中文档中已经说明了，那个dashed line是贡献的平均值，高于这个线表示某个变量的贡献大于平均水平。至于重不重要，那是另一个问题。即使一个变量的贡献小于平均值，在一定意义上也是重要的。

谢谢大家了

lww1993 发表于 2017-7-11 14:44
假定有k个变量，主成分分析中选择主成分个数一般有两个标准：
一是单个主成分的贡献率大于1/k，也就是说变 ...

你好，请问这种有可参考的专著或文献吗 求分享