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[问答] 能否通过贝叶斯的credible interval比较不同水平间的差异 [推广有奖]

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头不能再大了 发表于 2017-7-18 10:05:02 |AI写论文

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这里有一个分层模型的问题,想请教一下大家。

小弟的试验中,响应变量是RB,固定因素是treatment(四个水平为ck tr1 tr2 tr3),随机因素是year和block。我想分别比较ck和tr1 tr2 tr3的差异,即不关注tr1 tr2 tr3 三者之间的差异。

我用R做的,不过我想对于结果的解释应该跟软件无关。

我想请教一下:
(1)能否直接根据summary的结果,得出“tr1和ck的差异不显著,tr2 tr3和ck的差异显著“的结论?
(2)我能使用附图这样的方式来表示这种差异么?
(3)方法中我能用类似下面的话描述这种统计方法么?“ In the model, the RB under "ck" was set as the intercept, so for the other three conditions ("tr1","tr2" and "tr3"), 95% credibility interval that not overlapping zero indicate a significant difference from that in "ck" "


  1. library(MCMCglmm)
  2. fit1<-MCMCglmm(RB~Treatment,random=~Year+Block,data=tempRB)

  3. summary(fit1)

  4. Iterations = 3001:12991
  5. Thinning interval  = 10
  6. Sample size  = 1000

  7. DIC: -14.23551

  8. G-structure:  ~Year

  9. post.mean l-95% CI u-95% CI eff.samp
  10. Year    0.3482  6.4e-56   0.1674      436

  11.            ~Block

  12. post.mean  l-95% CI  u-95% CI eff.samp
  13. Block 0.0001119 1.156e-66 3.083e-08    798.7

  14. R-structure:  ~units

  15. post.mean l-95% CI u-95% CI eff.samp
  16. units   0.02743  0.01134    0.048      114

  17. Location effects: RB ~ Treatment

  18.               **post.mean  l-95% CI  u-95% CI eff.samp  pMCMC   
  19. (Intercept)    0.660959  0.391469  0.878285     1000  0.024 *  
  20. Treatment_tr1 -0.004188 -0.207064  0.179150     1000  0.966   
  21. Treatment_tr2 -0.387922 -0.586966 -0.186081     1085 <0.001 ***
  22. Treatment_tr3 -0.467356 -0.646885 -0.261730     1000 <0.001 *****
  23. ---
  24. Signif. codes:  0 ‘***’ 0.001 ‘**’ 0.01 ‘*’ 0.05 ‘.’ 0.1 ‘ ’ 1
复制代码
Fig.2_Difference from ck (1).JPG
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关键词:Interval inter Inte 不同水平 cred

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