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已有数据A：
gene     sample       weight
a             1             0.5

a             1             0.6

a             2             0.4
a             2             0.5
a             3             0.5
b             1             0.4
b             1             0.3
b             2             0.5
b             2             0.6
b             3             0.6
数据B：
sample   1        2        3
weight   0.5    0.6     0.7

目标：把数据A中的weight，减去数据B中对应Sample的weight，求问不提取或拆分A的情况下如何操作？

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关键词：处理数据 数据求助 Weight Sample weigh

left_join()配合transmute()很容易解决。

1. library(dplyr)
   
2. left_join(A,B,by="sample") %>%
   
3.         transmute(gene=gene,
   
4.                    sample=sample,
   
5.                    weight=weight.x-weight.y)

复制代码

屋檐滴语 发表于 2017-10-12 22:55
left_join()配合transmute()很容易解决。

这里有sample是rownames,应该要转成data.frame才可以用你的方法解决吧

用sqldf 包
select  A.gene   ,  A.sample   , (A.weight-B.Weight) as adjusted_weigh from A left join B on A.sample = B.sample


假设 B    已经 转化为  列 为

sample ，weight
   1           0.5
  2            0.6
   3           0.7

jiangbeilu 发表于 2017-10-13 08:49
这里有sample是rownames,应该要转成data.frame才可以用你的方法解决吧

是的，我直接是令B=data.frame(sampel=c(1,2,3),weight=c(0.5,0.6,0.7))
如果sample和weight是行名，那么1，2，3是以数字开头的，没法做为列名。

屋檐滴语 发表于 2017-10-13 10:47
是的，我直接是令B=data.frame(sampel=c(1,2,3),weight=c(0.5,0.6,0.7))
如果sample和weight是行名，那么 ...

那是可以

屋檐滴语 发表于 2017-10-12 22:55
left_join()配合transmute()很容易解决。

谢谢！试了一下，我的sample名实际上是1，2，3，4，CK，结果中只有CK匹配上了，可能是什么原因呢？

jameschin007 发表于 2017-10-13 09:31
用sqldf 包
select  A.gene   ,  A.sample   , (A.weight-B.Weight) as adjusted_weigh from A left join  ...

你好，我想问下，R中使用Update进行数据修改的时候，语法跟SQL的有区别吗？我按照SQL里面的语法写的，如下：
Data1=sqldf('update Data set mean_data.Item_Weight=Data.Item_Weight where Data.Item_Identifier=mean_data.Item_Identifier and Data.Item_Weight=""')

出现错误：Error in rsqlite_send_query(conn@ptr, statement) : near ".": syntax error

saly@123 发表于 2018-5-2 11:37
你好，我想问下，R中使用Update进行数据修改的时候，语法跟SQL的有区别吗？我按照SQL里面的语法写的，如下 ...

sqldf 只支持 select 语句。
如果用update， 建议用Rodbc包， 把dataframe 直接写到数据库表里，然后用sqlquery  做update语句

jameschin007 发表于 2018-5-2 11:47
sqldf 只支持 select 语句。
如果用update， 建议用Rodbc包， 把dataframe 直接写到数据库表里，然后用s ...

好的，谢谢您的解答。除了用Rodbc包之外，还有其他的方法可以修改特定的数据吗？