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[问答] 求助:r语言 DGEList函数 [推广有奖]

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楼主
帅的我一无是处 发表于 2018-2-8 10:44:10 |AI写论文
5论坛币


group=c(rep("normal",51),rep("tumor",481))                     
design <- model.matrix(~group)
y <- DGEList(counts=data,group=group)
y <- calcNormFactors(y)
y <- estimateCommonDisp(y)
y <- estimateTagwiseDisp(y)
et <- exactTest(y,pair = c("normal","tumor"))
topTags(et)
ordered_tags <- topTags(et, n=100000)


运行这一步时y <- DGEList(counts=data,group=group) 老是提示
Error in .isAllZero(counts) : counts must be positive finite values
这是怎么回事啊!!!

关键词:list gel Eli DGE IST

沙发
乐文义 发表于 2018-2-8 11:20:45
data改成group

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