基于隐马尔科夫模型的基因识别系统设计与实现

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摘要：随着基因组研究的发展，利用机器学习方法进行基因识别被广泛使用，这些方法包括神经网络算法、基于规则的方法、决策树、概率推理等。文章描述了一种基于隐马尔科夫模型的基因识别系统，介绍了EM训练算法和Viterbi序列分析算法，该系统运用Burset＆Guigo的公共数据集进行测试，核苷识别的Sn和Sp两个参数分别可以达到68％和88％，外显子识别的Sn和Sp参数达到60％和63％。

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关键词：马尔科夫模型 隐马尔科夫 系统设计 马尔科夫 马尔科 隐马尔科夫模型 基因识别 EM算法 Viterbi算法 机器学习方法