R语言中自主神经网络画图的若干问题

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我有几个问题哈

1. 这种图是kohonen包画出来的吗？ 还是som？还是别的什么
2.图中的颜色代表着什么

参考文献是：长江上游特有鱼类DNA条形码研究

我也有一组数据，想在在物种水平上，每个特有位点作的图，并使用所有特有位点，把几种物种区分开的图。应该如何实现？
请大手子告知。

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关键词：几个问题 如何实现 长江上游 特有鱼类 参考文献 R、SOM、神经网络

这篇博士论文里面不是说得很清楚吗，里面用到了那么多的软件！

文档里有详细的说明哦，实在看不懂英文用有道翻译