楼主: llb_321
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[实际应用] 原创:借助COVID19_SEIR_ODE模型比较早期控制对疫情防治的作用 [推广有奖]

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llb_321 在职认证  发表于 2020-4-1 00:44:24 |AI写论文

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一、模型:

采用本人编写的COVID19_SEIR_ODE

编写过程中参考了SEIRdeSolve、常微分方程ODE、延迟微分方程DDE等相关资料,对常见的SEIR模型作了改变。由于DDE的代码实现难度,本人最终放弃原来想以DDE方程建模的设想,仅以ODE建模。

实现环境:R 3.6.3+deSolve+ggplot2


二、SEIR模型变化:

1I分解成发病和入院两类。

2R分解为治愈和病故两类。

3、增加限制人口流动和接触的控制事件,以降低易感人群规模。


三、案例初始假定条件:

1、边界封闭,无人口流出流入。

2、不考虑医院收治能力限制。

3、潜伏期5t,发病至入院4t,住院至治愈13t,住院至病故10t

4、病故率3%,治愈率>90%

5、发病者接触感染概率0.1575,潜伏期接触感染概率0.7875(参考钟南山团队数据)。

6、人口基数1000万。


四、模型中的事件触发时点:

10t(无控制条件下,住院数达到百人以上),20t(无控制条件下,住院数达到千人以上)。


五、结果(D为病故,R为治愈,Ih为住院诊治):

1、无控制条件下

Dmax=40万,Rmax=945万,Ihmax=450

no mani.png

是不是有种如果不控制,每个人都会被过筛子的感觉?

210t时易感人群降至80%20t时再降至40%

Dmax=13万,Rmax=303万,Ihmax=104

85.png

310t时易感人群降至50%20t时再降至25%

Dmax=1.88万,Rmax=43万,Ihmax=8

55.png

上图已经不明显了,加一张不包括人口和易感人群的图。

551.png

410t时易感人群降至50%20t时再降至15%

Dmax=4千,Rmax=9.3万,Ihmax=3.2

531.png

好像找到了悲情城市武汉的视感,嗯。

六、结论:以上结果说明,在无法改变感染概率、治疗手段没有重大突破的条件下,在传染爆发早期采取限制人口流动和人际接触的措施,降低易感人群,对疫情防控可以起到关键性的作用。

原创声明:内容均为本人原创,数据本人模型可验证,转载请注明出处。另外,本文仅作学习参考,不作为实际案例研究。


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关键词:COVID19 SEIR ODE deSolve

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沙发
車樹森 学生认证  发表于 2020-4-1 13:20:18
回头看感染数据及现在对于病毒的特性的理解,能反映出政策的执行效果

藤椅
llb_321 在职认证  发表于 2020-4-1 16:06:18
車樹森 发表于 2020-4-1 13:20
回头看感染数据及现在对于病毒的特性的理解,能反映出政策的执行效果
传染性疾病不仅仅限于生物学、病理学、病毒学、流行病学的范畴,更重要的是社会学,包括社会网络、制度、社会控制、传播动力学、心理学。对人口流动和人际接触的控制,是最好的药。

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