8个流行的Python可视化工具包，你喜欢哪个？

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把这三个包放在一起有几个原因：首先 Seaborn 和 Pandas 是建立在 Matplotlib 之上的，当你在用 Seaborn 或 Pandas 中的 df.plot() 时，用的其实是别人用 Matplotlib 写的代码。因此，这些图在美化方面是相似的，自定义图时用的语法也都非常相似。

当提到这些可视化工具时，我想到三个词：探索（Exploratory）、数据（Data）、分析（Analysis）。这些包都很适合第一次探索数据，但要做演示时用这些包就不够了。

Matplotlib 是比较低级的库，但它所支持的自定义程度令人难以置信（所以不要简单地将其排除在演示所用的包之外！），但还有其它更适合做展示的工具。

Matplotlib 还可以选择样式（style selection），它模拟了像 ggplot2 和 xkcd 等很流行的美化工具。下面是我用 Matplotlib 及相关工具所做的示例图：

在处理篮球队薪资数据时，我想找出薪资中位数最高的团队。为了展示结果，我将每个球队的工资用颜色标成条形图，来说明球员加入哪一支球队才能获得更好的待遇。

1. import seaborn as sns
   
2. import matplotlib.pyplot as plt
   
3. color_order = ['xkcd:cerulean', 'xkcd:ocean',
   
4. 'xkcd:black','xkcd:royal purple',
   
5. 'xkcd:royal purple', 'xkcd:navy blue',
   
6. 'xkcd:powder blue', 'xkcd:light maroon',
   
7. 'xkcd:lightish blue','xkcd:navy']
   
8. sns.barplot(x=top10.Team,
   
9. y=top10.Salary,
   
10. palette=color_order).set_title('Teams with Highest Median Salary')
    
11. plt.ticklabel_format(style='sci', axis='y', scilimits=(0,0))

复制代码

第二个图是回归实验残差的 Q-Q 图。这张图的主要目的是展示如何用尽量少的线条做出一张有用的图，当然也许它可能不那么美观。

1. import matplotlib.pyplot as plt
   
2. import scipy.stats as stats
   
3. #model2 is a regression model
   
4. log_resid = model2.predict(X_test)-y_test
   
5. stats.probplot(log_resid, dist="norm", plot=plt)
   
6. plt.title("Normal Q-Q plot")
   
7. plt.show()

复制代码

最终证明，Matplotlib 及其相关工具的效率很高，但就演示而言它们并不是最好的工具。

ggplot(2)

你可能会问，「Aaron，ggplot 是 R 中最常用的可视化包，但你不是要写 Python 的包吗？」。人们已经在 Python 中实现了 ggplot2，复制了这个包从美化到语法的一切内容。

在我看过的所有材料中，它的一切都和 ggplot2 很像，但这个包的好处是它依赖于 Pandas Python 包。不过 Pandas Python 包最近弃用了一些方法，导致 Python 版本不兼容。

如果你想在 R 中用真正的 ggplot（除了依赖关系外，它们的外观、感觉以及语法都是一样的），我在另外一篇文章中对此进行过讨论。

也就是说，如果你一定要在 Python 中用 ggplot，那你就必须要安装 0.19.2 版的 Pandas，但我建议你最好不要为了使用较低级的绘图包而降低 Pandas 的版本。

ggplot2（我觉得也包括 Python 的 ggplot）举足轻重的原因是它们用「图形语法」来构建图片。基本前提是你可以实例化图，然后分别添加不同的特征；也就是说，你可以分别对标题、坐标轴、数据点以及趋势线等进行美化。

下面是 ggplot 代码的简单示例。我们先用 ggplot 实例化图，设置美化属性和数据，然后添加点、主题以及坐标轴和标题标签。

1. #All Salaries
   
2. ggplot(data=df, aes(x=season_start, y=salary, colour=team)) +
   
3. geom_point() +
   
4. theme(legend.position="none") +
   
5. labs(title = 'Salary Over Time', x='Year', y='Salary ($)')

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Bokeh

Bokeh 很美。从概念上讲，Bokeh 类似于 ggplot，它们都是用图形语法来构建图片，但 Bokeh 具备可以做出专业图形和商业报表且便于使用的界面。为了说明这一点，我根据 538 Masculinity Survey 数据集写了制作直方图的代码：

1. import pandas as pd
   
2. from bokeh.plotting import figure
   
3. from bokeh.io import show
   
4. # is_masc is a one-hot encoded dataframe of responses to the question:
   
5. # "Do you identify as masculine?"
   
6. #Dataframe Prep
   
7. counts = is_masc.sum()
   
8. resps = is_masc.columns
   
9. #Bokeh
   
10. p2 = figure(title='Do You View Yourself As Masculine?',
    
11. x_axis_label='Response',
    
12. y_axis_label='Count',
    
13. x_range=list(resps))
    
14. p2.vbar(x=resps, top=counts, width=0.6, fill_color='red', line_color='black')
    
15. show(p2)
    
16. #Pandas
    
17. counts.plot(kind='bar')

复制代码

用 Bokeh 表示调查结果

红色的条形图表示 538 个人关于「你认为自己有男子汉气概吗？」这一问题的答案。9~14 行的 Bokeh 代码构建了优雅且专业的响应计数直方图——字体大小、y 轴刻度和格式等都很合理。

我写的代码大部分都用于标记坐标轴和标题，以及为条形图添加颜色和边框。在制作美观且表现力强的图片时，我更倾向于使用 Bokeh——它已经帮我们完成了大量美化工作。

用 Pandas 表示相同的数据

蓝色的图是上面的第 17 行代码。这两个直方图的值是一样的，但目的不同。在探索性设置中，用 Pandas 写一行代码查看数据很方便，但 Bokeh 的美化功能非常强大。

Bokeh 提供的所有便利都要在 matplotlib 中自定义，包括 x 轴标签的角度、背景线、y 轴刻度以及字体（大小、斜体、粗体）等。下图展示了一些随机趋势，其自定义程度更高：使用了图例和不同的颜色和线条。

Bokeh 还是制作交互式商业报表的绝佳工具。

Plotly

Plotly 非常强大，但用它设置和创建图形都要花费大量时间，而且都不直观。在用 Plotly 忙活了大半个上午后，我几乎什么都没做出来，干脆直接去吃饭了。我只创建了不带坐标标签的条形图，以及无法删掉线条的「散点图」。Ploty 入门时有一些要注意的点：

• 安装时要有 API 秘钥，还要注册，不是只用 pip 安装就可以；Plotly 所绘制的数据和布局对象是独一无二的，但并不直观；图片布局对我来说没有用（40 行代码毫无意义！）
  

但它也有优点，而且设置中的所有缺点都有相应的解决方法：

• 你可以在 Plotly 网站和 Python 环境中编辑图片；支持交互式图片和商业报表；Plotly 与 Mapbox 合作，可以自定义地图；很有潜力绘制优秀图形。
  

以下是我针对这个包编写的代码：

1. #plot 1 - barplot
   
2. # **note** - the layout lines do nothing and trip no errors
   
3. data = [go.Bar(x=team_ave_df.team,
   
4. y=team_ave_df.turnovers_per_mp)]
   
5. layout = go.Layout(
   
6. title=go.layout.Title(
   
7. text='Turnovers per Minute by Team',
   
8. xref='paper',
   
9. x=0
   
10. ),
    
11. xaxis=go.layout.XAxis(
    
12. title = go.layout.xaxis.Title(
    
13. text='Team',
    
14. font=dict(
    
15. family='Courier New, monospace',
    
16. size=18,
    
17. color='#7f7f7f'
    
18. )
    
19. )
    
20. ),
    
21. yaxis=go.layout.YAxis(
    
22. title = go.layout.yaxis.Title(
    
23. text='Average Turnovers/Minute',
    
24. font=dict(
    
25. family='Courier New, monospace',
    
26. size=18,
    
27. color='#7f7f7f'
    
28. )
    
29. )
    
30. ),
    
31. autosize=True,
    
32. hovermode='closest')
    
33. py.iplot(figure_or_data=data, layout=layout, filename='jupyter-plot', sharing='public', fileopt='overwrite')
    
34. #plot 2 - attempt at a scatterplot
    
35. data = [go.Scatter(x=player_year.minutes_played,
    
36. y=player_year.salary,
    
37. marker=go.scatter.Marker(color='red',
    
38. size=3))]
    
39. layout = go.Layout(title="test",
    
40. xaxis=dict(title='why'),
    
41. yaxis=dict(title='plotly'))
    
42. py.iplot(figure_or_data=data, layout=layout, filename='jupyter-plot2', sharing='public')
    
43. [Image: image.png]

复制代码

表示不同 NBA 球队每分钟平均失误数的条形图。

表示薪水和在 NBA 的打球时间之间关系的散点图

总体来说，开箱即用的美化工具看起来很好，但我多次尝试逐字复制文档和修改坐标轴标签时却失败了。但下面的图展示了 Plotly 的潜力，以及我为什么要在它身上花好几个小时：

Plotly 页面上的一些示例图

Pygal

Pygal 的名气就不那么大了，和其它常用的绘图包一样，它也是用图形框架语法来构建图像的。由于绘图目标比较简单，因此这是一个相对简单的绘图包。使用 Pygal 非常简单：

• 实例化图片；用图片目标属性格式化；用 figure.add() 将数据添加到图片中。
  

我在使用 Pygal 的过程中遇到的主要问题在于图片渲染。必须要用 render_to_file 选项，然后在 web 浏览器中打开文件，才能看见我刚刚构建的东西。

最终看来这是值得的，因为图片是交互式的，有令人满意而且便于自定义的美化功能。总而言之，这个包看起来不错，但在文件的创建和渲染部分比较麻烦。

Networkx

虽然 Networkx 是基于 matplotlib 的，但它仍是图形分析和可视化的绝佳解决方案。图形和网络不是我的专业领域，但 Networkx 可以快速简便地用图形表示网络之间的连接。以下是我针对一个简单图形构建的不同的表示，以及一些从斯坦福 SNAP 下载的代码（关于绘制小型 Facebook 网络）。

我按编号（1~10）用颜色编码了每个节点，代码如下：

1. options = {
   
2. 'node_color' : range(len(G)),
   
3. 'node_size' : 300,
   
4. 'width' : 1,
   
5. 'with_labels' : False,
   
6. 'cmap' : plt.cm.coolwarm
   
7. }
   
8. nx.draw(G, **options)

复制代码

用于可视化上面提到的稀疏 Facebook 图形的代码如下：

1. import itertools
   
2. import networkx as nx
   
3. import matplotlib.pyplot as plt
   
4. f = open('data/facebook/1684.circles', 'r')
   
5. circles = [line.split() for line in f]
   
6. f.close()
   
7. network = []
   
8. for circ in circles:
   
9. cleaned = [int(val) for val in circ[1:]]
   
10. network.append(cleaned)
    
11. G = nx.Graph()
    
12. for v in network:
    
13. G.add_nodes_from(v)
    
14. edges = [itertools.combinations(net,2) for net in network]
    
15. for edge_group in edges:
    
16. G.add_edges_from(edge_group)
    
17. options = {
    
18. 'node_color' : 'lime',
    
19. 'node_size' : 3,
    
20. 'width' : 1,
    
21. 'with_labels' : False,
    
22. }
    
23. nx.draw(G, **options)

复制代码

这个图形非常稀疏，Networkx 通过最大化每个集群的间隔展现了这种稀疏化。

有很多数据可视化的包，但没法说哪个是最好的。希望阅读本文后，你可以了解到在不同的情境下，该如何使用不同的美化工具和代码。

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关键词：python 可视化 工具包 Combinations scatterplot

探索（Exploratory）、数据（Data）、分析（Analysis）

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