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在医学论文的撰写过程中，统计方法运用的正确与否直接关系到学术论文质量的高低。统计方法的正确选择与使用，不仅能保证科研工作顺利进行，而且使科研成果更具有科学性、代表性和普遍性，反之，如果使用不当或误用，会直接影响研究结果的质量，会使读者误解，甚至有时会导致错误的结论。为此，辑文编译现就医学论文中经常出现的统计学问题进行归纳总结，以期增强读者对医学论文中统计学正确运用的重视，并希望对医学期刊论文的写作有所帮助。
一、缺少必要的统计分析。数据结果未进行必要的统计学处理而随意下结论，作者对论文中的数据未做必要的统计学分析，只凭看数据表面的大小作出判断，就得出两者之间的差别有无显著性意义的统计结论，这显然是不符合科学性的。正确的做法是必须经过合理的正确的统计学处理得出结论，而不能想当然。
二、统计表达和描述方面存在问题。一是统计表中数据的含义未表达清楚，表中作者想要表达的内容太多，而致使表格繁杂，反而影响表达效果，令人难以读懂。二是统计图中坐标轴上的数据是随意标上去的或者等长的间隔所代表的数量不等，在直角坐标系中从任何一个数值开始作为横轴或纵轴的第一个刻度值。三是对统计学资料类型缺乏了解，用不适宜的统计学指标进行统计描述，如在表述定量资料时，不考察资料的分布情况，即使其偏离正态分布很远，仍然盲目采用均数±标准差的表达方式，这是不妥的。
三、定量资料统计方面存在的问题。一是当定量资料不满足参数检验的前提条件时，盲目套用参数检验方法。二是不管定量资料对应的实验设计类型是什么样的，一律使用单因素2水平设计定量资料的t检验或单因素多水平设计的方差分析。
四、定性资料统计方面存在的问题。一是把卡方检验误认为是万能的检验方法，无论什么样的定性资料一律用卡方检验统计分析。二是对分析资料的前提条件分析不足，盲目套用某些定性资料的统计分析方法。三是未对资料进行充分分析，盲目套用秩和检验。
五、简单线性相关与回归分析方面存在的问题。一是未对分析资料进行充分的分析，混淆了参数检验与非参数检验的应用前提，导致应用了错误的统计方法。二是缺乏相关的专业知识，盲目研究某些根本不相关的变量之间的相互关联的关系。三是不绘制反映两个定量变量变化趋势的散点图，盲目进行简单的相关与回归分析，常常因为某些异常点的出现而得出错误的结论。
六、多因素或多自变量的实验资料分析存在的问题。将原本属于多因素实验研究资料，拆分为一系列单因素的研究来分析，这种“化繁为简，化整为零”的处理方式，割裂了原先的整体设计，无法研究多因素之间的内在联系或交互作用，容易得出片面的、甚至是错误的结论。
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