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1994年的分税制实行至今，地方政府对中央转移支付的依赖越来越严重。现在，分税制改革作为深化财税改革的一部分，应该提到议事日程上来。
地方政府对中央转移支付依赖大，其重要原因是1994年中国设计分税制时，在理论上和实践上都存在一个重大缺陷，即平行的地方政府之间，没有坚持税源和税收一致性原则：现行的税制要求企业在注册地交税，而不是按照税源地交税，导致税收体制运行产生严重的一种现象：一个地区的税源所形成的税收，被另一地区征收了。这种矛盾，不是中央和地方之间的矛盾，而是地区之间的矛盾，而这种矛盾使得中国地区之间的财政收入差距非正常地扩大。
经研究，全国大概92%的税收都程度不同地存在着税收与税源不一致的问题。我们做过一些典型的调查，在一些省份，属于此省税源的税收被其他的省收走，占其整个省税收的比重超过20%。因此，我们应该认识到这种差距对地方政府收入的影响。比如，西气东输工程中，天然气从新疆运到上海，途经几千公里、十几个省，其中的营业税、所有运费形成的税收、所得税等税收中，60%上交给中央，其余40%全部上交上海市。沿途十几个省要为西气东输工程征用土地、维持治安、提供电力、提供服务，耗费大量的人力、财力、物力，但是这些省市却拿不到西气东输工程的一分钱税收。再比如，大同到秦皇岛的运煤铁路，完全没有在北京运行，仅仅是在山西与河北运行，就因为公司注册地在北京，它的税收便全部交给北京。山西大同拿不到税收，河北秦皇岛也拿不到。所以，中国地区间收入差距扩大的原因，相当一部分是税制造成的。
美国、欧洲，包括南美一些国家，他们税收立法的原则表现在两方面，第一是在横向之间要先按照税源，把平行地区的税收进行分配；第二才是中央和地方之间的税收分配。中国现在完全不考虑横向地区间的税收分配，直接就是中央、地方之间的税收分配。如果我们实现了税源和税收一致性，那么地区间的财政收入差距，就不会出现现在这么大的差距。中央转移支付的依赖性，或者规模也比现在小得多。同时，税收征收的成本，包括转移支付的管理成本也会低很多。我们现行的税制体系是，先使地区间收入差距拉大，然后通过转移支付缩小差距，效率很低、成本很高。
以我之见，分税制的深化改革，可以学习发达市场经济国家的经验。首先，解决地区之间税收与税源一致性的原则。2008年新《企业所得税法》推出时，全国人大已经部分接受这个意见，通过税法形成决议，要求国务院对企业总部的税收在不同分公司之间进行分配。但是，国务院后来出台的办法不能令人满意。按照国务院的办法，其一，绝大多数中央企业，即企业总部的税收不向各地分配；其二，参加分配范围的企业税收规模很小，从中只分一部分税收。从原则上说，税收与税源一致性有了质的突破，因为中国过去的税收立法，从没要求按照税源产生的来源分配。但是，目前具体的分配办法仍不能令人满意。
其次，从以上分析可以看出，如果仅仅研究分税制本身，或者仅仅研究中央地方税收的分配关系，不对税制的立法原则和设计原则做调整，那想完成分税制改革、减少地方财政收入差距和地方政府对转移支付的依赖，非常困难。
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