课件_m6A+RNA甲基化文章套路

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m6A RNA甲基化文章套路
     --生信自学网光俊
主要内容
  简介
  数据下载
  数据整理
  m6A相关基因表达
  m6A差异分析(差异表格、热图、小提琴图)
  临床数据下载和整理
  肿瘤分型subtype (主成分分析、生存分析、临床相关性)
  单因素COX分析
  Lasso模型构建
  风险生存分析
  ROC曲线
  风险热图
  独立预后分析
 m6A RNA甲基化
  RNA修饰是一种转录后水平的调控方式，目前已鉴定到超过150种RNA修饰，
它们广泛分布于各类 RNA，如信使 RNA (mRNA)、 转运RNA(tRNA)、核糖体
RNA (rRNA)、非编码小 RNA (sncRNA)和长链非编码 RNA (lncRNA) 。
  RNA甲基化修饰约占所有RNA修饰的60%以上，而m6A(6-甲基腺嘌呤)是高
等生物mRNA上最为常见的一类RNA甲基化修饰。转录本m6A的修饰水平受甲基
转移酶(编码器)、结合蛋白(读码器)和去甲基化酶(消码器)的动态调控。

甲基转移酶(编码器) ： KIAA1429, MET ...

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关键词：subtype 主成分分析 LASSO ROC曲线 数据下载