楼主: xingkong626
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[问答] R 无法分配大小为。。。的矢量? [推广有奖]

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xingkong626 发表于 2012-12-12 15:27:31 |AI写论文

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我在对affy芯片进行GCRMA归一化,我发现必须要把所有的原始芯片cel数据一起归一化,但是我的芯片数据有120个,即约2.5G。
因为太大,所以我使用memory.limit(4000)来提高分配内存大小,但电脑还提醒我 :无法分配大小为。。的矢量。
当我减少到12个样本,电脑竟然还提醒我无法分配大小为124.0MB的矢量。
但我已经给了他4个G的内存了,并且用memory.limit()显示也为4000,百度google很久,实在无法解决,只有向论坛内请教。


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关键词:无法分配 百度google memory Google limit 百度google

沙发
cl1024 发表于 2012-12-12 15:33:23
帮顶一下~~~!

藤椅
xingkong626 发表于 2012-12-12 15:34:45
cl1024 发表于 2012-12-12 15:33
帮顶一下~~~!
谢谢了!

板凳
arccos2002 发表于 2012-12-12 15:48:49
64 位的试一下。

报纸
xingkong626 发表于 2012-12-12 15:52:20
arccos2002 发表于 2012-12-12 15:48
64 位的试一下。
我试过台式机的win xp ,可以跑12个芯片数据。

但为什么我的内存2个G, 甚至12个数据124M都无法运算?

多谢您的回复!

地板
arccos2002 发表于 2012-12-12 16:51:40
帮助写的很清楚啊
max       
logical. If TRUE the maximum amount of memory obtained from the OS is reported, if FALSE the amount currently in use, if NA the memory limit.

size       
numeric. If NA report the memory limit, otherwise request a new limit, in Mb. Only values of up to 4095 are allowed on 32-bit R builds, but see ‘Details’.

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showbox33 发表于 2012-12-12 17:01:04
我 用R读 过的 数据最大是 300M左右 ,处理过程中运算 复杂的 话会出问题
笔记本 dual core 2.0Ghz,3G内存

8
babybaby 发表于 2012-12-13 07:33:45
还是用sas吧。
大数据, R 还是不行。

9
金陵三 发表于 2013-4-8 20:59:50
我也遇到相似问题,求解决办法。。。。

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410234198 发表于 2013-7-17 13:35:37
同求解决,听说用bigmemory包?

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