关于multiple testing的问题

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最近在做老师给的一个课程作业，其中遇到一些问题。希望有人能够帮忙解决。
有一组数据一共有128个人，其中包括60个patient with colorectal cancer，其他68个是control组的。对每个人的48个genes的基因表达程度进行了收集，得到相关数据。要分析出来那个基因会影响cancer。

老师给出了一种方法。就是先分别对每个基因进行rank。分别选取top 25%，50%，75%和bottom25%，50%，75%的patient和control的数据来做6组two sample t test。这样会得到6组t值，选取最大的那个t值的选取数据作为代表。
然后relable patient和control组，按照上述方法继续求t值，relable了1000次。计算出了所有大于第一次t值的次数n，p值就是n/1000。这时候在0.05的情况下有5组基因是显著的。

然后用multiple testing中的修正t值，用FDR求出ajust p值，可是在这个时候在0.05的情况下没有基因是显著了。

现在要改进这个方法，求问还有些什么统计方法可以找出patient和control组的那些基因会影响cancer啊。还有就是关于那个rank 25% 50% 75%的方法 有什么优点啊。我自己感觉可以直接用最简单的two sample test做检验出来p value 在用FDR做adjust p value啊~~~~
求大神指导

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关键词：Multiple TESTING multip multi test multiple testing control cancer 最大的

这是一个正常的问题，单次两两比较，当然有显著的，但是综合起来有可能出现不显著的情况