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[问答] Affy中一个基因对应几个探针号,怎么处理成一对一关系 [推广有奖]

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飞天小猫1117 发表于 2013-12-11 21:02:27 |AI写论文

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基因芯片是hgu133plus2, 把cel文件用R提取出基因表达数据,发现每个探针号对应一个基因表达值,而一个基因对应几个探针号,也就是一个基因对应几个基因表达值,怎么处理成一个基因对应一个基因表达值呢,牛人们能给个代码吗,感激不尽!
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关键词:怎么处理 一对一 基因表达 PLUS 感激不尽 一对一

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沙发
nuomin 发表于 2013-12-23 07:40:31
贴一个简单的矩阵,把你想要的结果写出来,这样想帮你也容易些

藤椅
zhumengjin 发表于 2013-12-31 21:25:14
# Function to average the expression of probesets which map to same gene
probeset2genelevel = function (x)
return(tapply(x, factor(rownames(eset)), mean))

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