可重复性报告？？？求大神指明方向

是 否 +2 论坛币

k人 参与回答

经管之家送您一份

应届毕业生专属福利!

求职就业群

赵安豆老师微信：zhaoandou666

经管之家联合CDA

送您一个全额奖学金名额~ !

立即领取

感谢您参与论坛问题回答

经管之家送您两个论坛币！

+2 论坛币

本人学医出生，一直使用SAS软件生成统计分析表格，SAS里面的宏可以直接生成如下的表格：

数据见附件： data.xlsx (9.64 KB)

2014-4-13 09:29:01 上传

数据

拟合的是单因素生存分析，也就是

1. cph(Surv(os, os_cencor)~trt,data=data)
   
2. cph(Surv(os, os_cencor)~Sex,data=data)
   
3. cph(Surv(os, os_cencor)~Age,data=data)

复制代码

然后提取结果，生成上面的表；
我现在的问题是如何用R实现，并且自动生成表格，当数据变化时只要运行程序，表格就更新了。我也初步搜索了相关可重复研究的内容，谢大神的knitr包也研究过，关键是要和latex接口，本人没有latex背景，看起来着实费劲，不知哪位大神是否有看法，能告诉我努力的方向，哪怕是一本书，或者某个包。
再者，如果哪位大神愿意私下交流的话，我的QQ280516394. 必有重谢

扫码加我 拉你入群

请注明：姓名-公司-职位

以便审核进群资格，未注明则拒绝

分享0 收藏0 回帖

关键词：重复性 LaTeX sas软件 Data atex 运行程序 接口 如何 软件 统计

Sweave可以做reproducible analysis。LZ可以google一下。

sweave还不如stargazer靠谱，但是stargazer定义的格式多数为AER等国外期刊，而且也是基于LaTex的，还真是找不到现成的可以输出到Excel的包，好像有个第三方的收费的东西，装个插件貌似可以。我也一直关注着这方面呢~~

knitr有word接口，也可以利用pandoc进行转换。
谢大的主页有很多例子，楼主可以去看。
还有texreg包

ltx5151 发表于 2014-4-13 10:04
Sweave可以做reproducible analysis。LZ可以google一下。

其实小弟已经google很多回了，没有找到满意的内容，还望大侠说明进步路线图

luisluan 发表于 2014-4-13 10:53
sweave还不如stargazer靠谱，但是stargazer定义的格式多数为AER等国外期刊，而且也是基于LaTex的，还真是找 ...

谢谢，如果收费的话那还是转向SAS了

ywh19860616 发表于 2014-4-13 11:46
knitr有word接口，也可以利用pandoc进行转换。
谢大的主页有很多例子，楼主可以去看。
还有texreg包

在官网搜索，有很多重复性研究的包，不知大侠是否知道，要实现我的目标，重点看哪些包？谢谢

把结果做成data.frame，写入csv格式文件就可以了，直接用excel打开的。或者用RODBC写入到EXCEL文件。我喜欢用第一个方法。第二个方法磨叽。

flyloop 发表于 2014-4-13 16:42
其实小弟已经google很多回了，没有找到满意的内容，还望大侠说明进步路线图

http://users.stat.umn.edu/~geyer/Sweave/
在My example - intro
那里有一个例子。其实Sweave主要作用于.Rnw文件。.Rnw文件是一个类似与.tex的文件，唯一的不同格式中加用特殊的Sweave字符插入了R code。然后在R下面对该文件运行Sweave，就会生成相应的.tex文件，其中R的暑促内容已经被自动插入了。这样你就按照正常编译.tex的方式编译就可以了。楼下说的knitr也是一个选择。Sweave更常规一些，knitr是新生产品，但是有很多不错的feature。

ltx5151 发表于 2014-4-14 10:08
http://users.stat.umn.edu/~geyer/Sweave/
在My example - intro
那里有一个例子。其实Sweave主要作用 ...

谢谢热心帮助。还是用knitr吧。目前的关键问题是做一个很多变量的表格：思路，latex语法在R里面画一个自己想要的表格，然后提取相关分析的结果填到每个表格单元格。带来的麻烦是如果表格很多，分析很多，这个过程也很麻烦，没有SAS里面的宏方便，估计还是我没有理解到R的精髓