江湖救急：如何遍历数据框并按条件替换数据 - R语言论坛

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zjalf2 发表于 2016-7-19 13:50:07 |只看作者 |坛友微信交流群|倒序 |AI写论文

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求教大神：
数据集为基因型数据，第一列为”父本/母本“，后面各列为待替换的数据。替换规则为：
父本父本 <- "A"
母本母本<- "B"
父本母本<- "H"
其他 <- "NN"
以第一行数据为列，“G/T"，则GG替换为A，TT替换为B，GT则替换为H。

allele

LP103

LP157

LP154

LP111

LP241

sBPA053

sDBA090

LP97

sBPA034

LP217

sBPA028

LP254

G/T

GG

GT

GG

GT

GG

GT

GG

G/A

GA

GG

GA

GG

A/G

AG

AA

AG

AA

AG

AA

T/C

CC

TC

CC

TC

CC

TT

C/T

CT

CC

A/T

AA

AT

AA

NN

AA

TT

C/T

CT

NN

CT

NN

CT

CC

T/C

CC

TT

CC

TT

CC

TT

T/C

TC

TT

TC

NN

TC

TT

TC

TT

G/A

GA

GG

GA

GG

C/T

CC

CT

CC

T/A

TT

T/A

TA

TT

TA

TT

C/A

CC

G/A

GA

GG

GA

GG

GA

GG

G/A

GG

AA

GG

C/T

CC

NN

CC

C/T

CC

NN

CC

T/A

TT

NN

TT

G/A

GG

A/G

AA

GG

AA

A/G

GG

T/G

GG

NN

GG

C/G

CC

NN

CC

NN

CC

T/C

TT

C/A

CC

C/T

CC

G/A

AA

G/A

GG

AA

GG

NN

GG

AA

G/A

GG

T/C

TT

G/A

GG

NN

GG

NN

A/G

AA

NN

AA

NN

G/A

AA

GG

AA

GG

GA

GG

GA

AA

GG

G/A

GG

G/A

GG

AA

GG

C/T

TT

G/A

GG

AA

GG

AA

C/G

CC

GG

CC

GG

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关键词：江湖救急数据框基因型数据集江湖如何

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沙发

十里春风

发表于 2016-7-19 17:04:13 |只看作者 |坛友微信交流群

x<-c('G/T','GG','GT','GT','GG','GT','GG','GT','GT','GT','GT','GG','GG')
y<-x[-1]
ss<-strsplit(x[1],'/')[[1]]
pat<-c(paste(ss,ss,sep=''),paste(ss[1],ss[2],sep=''))
y[y==pat[1]]<-'A'
y[y==pat[2]]<-'B'
y[y==pat[3]]<-'H'

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藤椅

zjalf2 发表于 2016-7-20 11:47:14 |只看作者 |坛友微信交流群

十里春风发表于 2016-7-19 17:04

多谢，问题解决了

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板凳

axia991031 发表于 2019-1-27 22:22:20 |只看作者 |坛友微信交流群

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