已设置过set.seed，为什么用马尔可夫链做状态转换模型，每次结果都不一样

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已经设置过set.seed，即固定了后续运行所用的随机数。
按理说，利用马尔科夫链和EM算法求解状态转换解集时，每次运行后的结果应该一致？
但是，为什么我的结果每次都不一样？  
有人做过类似模型没？知道如何处理吗？

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关键词：马尔可夫链 seed 马尔可夫 see Set 模型