楼主: lanhong1993
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[问答] 如何进行ATCG配对? [推广有奖]

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lanhong1993 发表于 2018-1-12 19:34:44 |AI写论文

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如题,怎么样编写这样一个函数:输入任意长度的字母“ATCGTGACGGTA”,输出结果“TAGCACTGCCAT”.
原则是:A配T,C配G
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关键词:ATC TCG 输出结果 tga tag

沙发
jiangbeilu 学生认证  发表于 2018-1-13 14:45:04
用plyr包里的mapvalues函数来解决吧,具体见如下代码。
  1. x <- "ATCGTGACGGTA"
  2. library(plyr)
  3. atcg_sub <- function(x){
  4.     ## need 'plyr' package
  5.     orig <- c('A','T','C','G')
  6.     corre <- c('T','A','G','C')
  7.     res <- plyr::mapvalues(strsplit(x,'')[[1]],orig,corre)
  8.     res <- paste0(res,collapse='')
  9.     return (res)
  10. }
  11. atcg_sub(x)
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