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首先需要说明的是，核心期刊的评选并不是ZF行为，新闻出版部门从来没有对期刊进行过分级处理，因此，核心期刊的评选实际上是一种民间行为。具体来说，是某些高等院校或者科研院所基于某种目的，以一定的标准为依据，从公开发行的期刊中遴选出来的。因为不同评价单位有着不同的评价标准，因此，核心期刊也就有了很多不同的版本。
现在，影响力较大的核心期刊版本有以下几种.
1，全国中文核心期刊，又称北大核心。是北京大学图书馆制定的，每四年修订一次，现在使用的是2008年版本。北大核心内容涉及自然科学和社会科学，可以说是影响力最大的一个版本，目前被国内众多高校用作职称评定、科研奖励的重要参考依据。
2，中国人文社会科学引文索引（CSSCI），又称南大核心。是南京大学中文社会科学研究评价中心制定的，每两次修订一次，主要面向社会科学领域。与北大核心相比，CSSCI入选的期刊数量较少，因此所选期刊具有更高的学术水平。对于一些没有被收录但同样具备较高学术水平的期刊，又设立CSSCI扩展版来源期刊。
3，中国人文社会科学核心期刊。是中国社会科学院制定的，主要面向社会科学领域，在国内也具有一定的影响力。对于一些具备办刊特色，但由于数据原因而没有入选的期刊，又设立“中国人文社会科学核心期刊·专家推荐期刊”。
4，RCCSE中国核心学术期刊。这是一个比较新的核心期刊评价体系，由中国科学评价研究中心、武汉大学图书馆、武汉大学信息管理学院共同研发。由于是一个比较新的核心期刊评价体系，目前尚没有得到广泛的认可。
5，中国人文社科学报核心期刊。是由中国人文社科学报研究会评选并发布的。该核心期刊的评选范围仅限于我国高等院校主办的学报类期刊，所评选出的学报均为学报中影响因子较高或独具特色的期刊。该核心期刊版本由于评选范围比较狭窄，目前尚没有得到广泛使用。但将视角放在了容易被忽视的学报类期刊上，起到了拾遗补漏的作用。（类似核心还有“全国高职高专学报核心期刊”、“全国高职成高学报核心期刊”等）
6，中国科学引文数据库来源期刊（CSCD）。是由中国科学院文献情报中心制定。该核心主要面向自然科学领域，分为核心库和扩展库，数据库的来源期刊每两年进行评选一次。核心库的来源期刊经过严格的评选,是各学科领域中具有权威性和代表性的核心期刊。扩展库的来源期刊经过大范围的遴选，是我国各学科领域优秀的期刊。
7，中国科技论文统计源期刊（中国科技核心期刊）。是由中国科学技术信息研究所制定，学科范畴主要为自然科学领域，是目前国内比较公认的科技统计源期刊目录。目前实行三年动态管理，即三年评定一次，一次评定三年有效。
8，全国报刊索引核心期刊。《全国报刊索引》是由上海图书馆创办的国内首家大型综合性报刊检索工具。2008年，《全国报刊索引》编辑部研制的“核心期刊”正式面世。至此，中国核心期刊遴选评价机构又增加了一名新成员。《全国报刊索引》编辑部仅针对其遴选出的1736种学术期刊，将其分为“哲学社会科学版”和“自然科学技术版”，从而改变了原来检索全国报刊的传统做法。
9，中国核心期刊（遴选）数据库。由万方数据股份有限公司建设。万方数据股份有限公司以中国数字化期刊群为基础，在中国科技信息研究所的领导下，整合集成了多年建设的中国科技文献数据库、中国科技论文与引文数据库以及其他相关数据库中的期刊条目，形成了中国核心期刊遴选数据库。
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