楼主: shizhf
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[问答] 求助R PACKAGE biomark [推广有奖]

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shizhf 发表于 2011-6-14 11:37:56 |AI写论文

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各位老师同学,我用R 的biomark包
data(spikedApples)
apple.coef <- get.biom(X = spikedApples$dataMatrix,Y = rep(1:2, each = 10))
用他的数据没问题,我自己用excel编辑的数据却怎么都不行,提示ERROR: ncol(X)
不知道用我们自己编辑什么样的数据结构 可以用它来处理 ,谢谢!
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关键词:package biomark IOMA Mark Pack 求助 package biomark

沙发
DM小菜鸟 发表于 2014-12-15 14:17:58
这个提示是列向量出问题了吧
你检查一下你上下的命令和你的数据矩阵
有没有未标清名头的,要这样的格式——SpikePos$annotation[,c("rt", "mz")]
  
这里有一个小例子——
  
data(SpikeNeg)
plot(SpikeNeg$annotation[,c("rt", "mz")],
     xlab = "Time (s)", ylab = "m/z",
     main = "Negative ionization mode")
points(neg.markers[!is.na(neg.markers$feature.nr), c("rt", "mz")],
       pch = 19, col = 2)
 
要想进一步了解,数据扔上来的说~

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