楼主: lnxu
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R求作物的遗传力及其参数或BLUP的软件包 [推广有奖]

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1。如何用R求作物的遗传力及其参数

2.如何用R求BLUP  ,软件包是那个

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关键词:BLUP 软件包 Blu 遗传力 如何用 软件包 参数 作物 BLUP 遗传力

沙发
yahoocom 发表于 2009-4-25 23:15:00 |只看作者 |坛友微信交流群
这个专业性太强了,可能了解的人不多。

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shfujim 发表于 2009-8-20 16:19:24 |只看作者 |坛友微信交流群
这个有点为难R罗,要进行BLUP计算,数据量肯定不是一般级别的拉。R里面有一些包是做数量遗传分析的,但是都很有限,MCMCglmm,qgen等。推荐用PEST,WOBAT,Asreml进行分析。前两个是免费软件,后面的是商业软件,提供30天试用。
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Biostatistician 发表于 2009-8-24 20:20:39 |只看作者 |坛友微信交流群
楼上说的对,我也补充一个软件,叫DMU,我们课题组就用这个,挺不错的,为了速度别考虑R算方差组分和BLUP了

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shfujim 发表于 2009-8-28 19:06:22 |只看作者 |坛友微信交流群
Biostatistician 发表于 2009-8-24 20:20
楼上说的对,我也补充一个软件,叫DMU,我们课题组就用这个,挺不错的,为了速度别考虑R算方差组分和BLUP了
我也有WOMBAT软件,就是原来的DFREML。不过他那个好像要在LInux下面计算的更快些,再Windows下面运行效率不是很高,软件作者已经就事先申明的。请问楼上怎么解决这个问题的阿?学习Linux么?我们课题组准备买个商业软件的?给点建议吧?谢谢。
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zhumengjin 发表于 2009-12-20 14:03:55 |只看作者 |坛友微信交流群
免费软件MatVEC也可以用来估计BLUP。

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zhumengjin 发表于 2009-12-20 14:04:57 |只看作者 |坛友微信交流群
Matlab,SAS,R都有遗传分析的现成程序,不过都不完善。

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ye702 发表于 2010-11-24 11:27:09 |只看作者 |坛友微信交流群
WOMBAT软件是如何使用的?请各位帮一帮,谢谢!

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ye702 发表于 2011-11-1 21:25:09 |只看作者 |坛友微信交流群
我也想知道DMU的使用方法!!!

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amagicpig 发表于 2012-1-12 16:10:14 |只看作者 |坛友微信交流群
我正在用DMU做

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