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去年年底，《“健康中国2030”规划纲要》发布，其中在医药产业中指出，要推进医药流通行业转型升级，提高流通市场集中度，形成一批跨国大型药品流通企业。在两票制和营改增的大政之下。前不久，CFDA发布了2016年度食品药品监管统计年报，数据显示，法人批发企业为11794家、非法人批发企业1181家。往前推一年，这个数字是法人批发企业11959家、非法人批发企业1549家，按照这个对比数字，仅过去一年，已经有533家医药流通企业消失。
福建是最早实施两票制的省份，在2014年6月便发布了《福建省2014年医疗竞购药品集中招标采购实施意见》，取消分片区配送模式，实行全省统一配送，严格执行“两票制”政策。在具体执行方面，福建省要求各采购片区集中采购药品配送企业总数原则上不超过10家;福建省食药监局遴选确定11家基药配送企业，具备全省基药和非基药配送资格;各采购片区的基药只选择从11家中选择，非基药配送企业必须从11家中选择3家以上。该政策一执行，除了上述11家企业之外，其余的必定排斥在主流市场以外。数据显示，福建省未执行两票制之前，药品配送上达170多家，但是执行两票制两年后，2016年时福建配送商仅剩40左右，77%的医药商业公司被淘汰。
从福建案例来看，两票制的威力不可谓不大。现在，全国除了江西、山东、河南、新疆、西藏5省(自治区)还未出台关于两票制的具体方案及执行时间之外，已经有26省出台了两票制正式文件。虽然目前26省执行两票制的内容不尽相同，且都留给企业过渡时期，但是从国家将两票制当做医改顶层设计的内容而言，在执行上向福建靠拢是大势所趋。按照福建的77%的淘汰率，那么两三年后，整个医药流通企业就会达到此前行业所说的中国只需要的3000家左右的医药商业企业的目标。
CFDA虽然不是两票制执行的主体，但是其一方面在大力支持两票制，在监管层面全力配合;另一方面，CFDA在自己的主打领域，进行大力度的淘汰，即通过GSP的认证、飞检形式进行淘汰。根据公开数据显示，2016年CFDA总共撤销了不过200多张GSP证书，但是今年以来不完全统计的数据显示，全国已经有320家企业的GSP证书被撤销。其中河北省撤销94家、广东省51家、山东省43家、吉林省25家、甘肃省19家。从数据来看，不难发现，在扭转医药流通乱象方面，国家层面已经有自己整体的思路，各个部门之间正在形成合力，加大速度剔除哪些违背市场经济规律的“怪胎”。
对于医药商业企业而言，依照两票制的执行，未来缺乏品种资源和终端医院覆盖不足的区域性中小商业公司成为第一波出局者，而随着监管力度(飞检+票据查处)的加大，部分非规范性企业也将逐步推出市场，而拥有较强上游资源以及下游资源的优势龙头商业将会在这轮胜出，未来将会形成国药、华润、上药、九州通全国性商业公司+N个省级区域龙头的商业格局。
而被淘汰出去的企业路在何方?按照此前的数据，倒闭会是一部分，但是这个占比不会很大，大多数会有三种选择：第一种成为CSO机构代理商。第二种出路是成为大型流通企业并购标的，迅速成为某些大型商业公司还未完善布局省份的主力企业。第三种是从大势判断以及淘汰率的情况来看，每个省份将集中在30家上下的优质配送商手中，只要企业迅速杀进这个序列，或许可以勉力一搏。对于生产企业而言，两票制的执行虽然不会面临立刻消失的风险，但是必须有自己的一套新应对方案。这个方案中，首先面对的财税处理难度的飙升；规避面临日趋严格的财税和法律风险；销售成本的增加，；营销难度加大；商业回款周期变化剧烈。
新思界医药行业研究人士表示，“两票制”的实施，统一了流通环节中的商业性“垄断”，物流环节非常透明，货物流向非常清楚，特别是处方药产品的流通，将在很大程度上扼制让制药企业头痛的“窜货”问题。“两票制”促使当前药品流通格局发生重大调整，中间多余的商业都将被压缩掉。
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