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在医学论文主题标引中，副主题词的使用有着特殊意义。一方面，利用副主题词可将一篇论文的主题限定在一个或几个方面，从而缩小该主题的范围，加强标引和检索的专指性，提高查准率。另一方面，将某个方面的论文集中在某一副主题词之下，通过族性检索，可以提高查全率。为提高医学论文副主题词的标引质量，辑文编译提出以下几点建议。
一、熟悉相关标引工具。例如，MeSHALL是标引人员必备工具书之一。它收录了专题和资料类型2种副主题词，与主题词一起按照字顺排列，其标引注释与历史注释提供了副主题词的组配范围、动态性变化等信息。主题词的标引注释明确了主题词在一般允许组配范围以外的特殊标引规则。如禁用组配、特殊允许组配、限定组配的副主题词等，这些都是正确使用副主题词的重要依据。另外，主题词下的关于主题词/副主题词组配参照，提供了先组词的信息，可以避免无效组配。
二、熟悉副主题词的标引规则，适当补充相关医学知识。泛指性、动态性、等级性、规范性是副主题词的四大基本特征。深刻理解并真正掌握这些特征是正确使用副主题词的前提。标引人员应该掌握MEDLARS系统中副主题词的定义、标引的具体注意事项，并熟悉其组配范畴、特例组配、使用模式。另外，由于医学学科的复杂性，医学论文的标引对标引人员提出了更高的要求。标引人员应该具备扎实的医学基础知识。根据标引需要还应深入了解个别医学领域的具体知识、科研动态、新名词术语等。
三、掌握副主题词表达主题概念间的逻辑关系。掌握副主题词表达主题概念间的逻辑关系是准确标引的保证。标引人员应理解常见的概念间的关系类型，掌握如何用副主题词表达这些逻辑关系。常见的概念间的关系类型主要有以下几种：
1.并列关系。即在概念关系上处于同等并列地位。
2.交叉关系。某一主题概念是由处于同等地位的两个或多个主题交叉后的结果。
3.限定关系。一个概念被其他概念从不同角度进行限定。
4.因果关系。主题概念间存在前因后果的逻辑关系。
5.影响关系。主题概念间存在影响与被影响的逻辑关系。
6.应用关系。主题概念间存在应用与被应用的逻辑关系。
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