有一个距离矩阵 23288 * 23288(是稀疏的, object.size 1824203192 bytes)想通过dbscan的 "dist" method 来聚类 但是报错了
Error in asMethod(object) :
Cholmod error 'out of memory' at file ../Core/cholmod_memory.c, line 147
不知道有什么方法可以处理?
好像可以通过 Matrix的 sprasematrix 转化为稀疏矩阵可以处理,但是没看到能直接转化原有matrix的途径,好像要specifying the locations (row and column) 来转化;
好像也可以通过bigmemory 储存matrix,但是好像使用matrix的时候格式又会有点问题。
好吧 上述只是个人猜测 没用过上述两个包 R怎么处理比较大的数据 没什么经验。
求助~~~~