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从事科学基金项目研究，其任务和整个过程是围绕科学问题展开的。根据提出问题的内容、性质和角度的不同，可把科学问题主要归纳为回答“是什么”的陈述型、回答“怎么样”的过程型和回答“为什么”的因果型等三种主要形式。科学问题规定着科学研究的内容、方向、途径方法和手段，决定着科学研究的结果和价值。下面，医刊汇编译结合工作体会，围绕科学问题探讨科学基金申请书主要内容的撰写。
一、立项依据。立项依据包括研究意义、国内外研究现状及分析，附主要参考文献目录。依据科学基金要求，对于基础研究，要简要阐明研究工作的科学背景、主要目的、范围；对于应用基础研究，简要说明研究工作的工程背景、主要目的和范围。因此，主要回答在前期的研究工作基础上，发现什么科学问题，这个科学问题的必要性、先进性及新颖性。阐明为什么要选择该科学问题，该科学问题在国内外处于什么地位，要研究什么，能做什么工作等。
二、项目的研究内容、研究目标、拟解决的关键问题。研究内容要以科学问题为导向，紧紧围绕科学目标，集中精力解决科学问题。本质上是要对物质运动现象的演化过程提出假设、建立模型、进行科学描述、提出判据及进行评估、评价等，对此等问题有一个清晰基础上的研究思路。研究目标，是针对所研究的科学问题，探讨、揭示什么规律或发生机理，提出、建立什么理论模型、判据，阐明、阐述什么原理，证实什么结果，解决什么问题，达到什么目的。拟解决的关键问题，是指对于已经分解的科学问题中的研究难点或重点问题。
三、拟采取的研究方案及可行性分析。拟采取的研究方案包括有关方法、技术路线、实验手段、关键技术等。围绕科学问题，采用必要的具体分析方法，如理论分析方法、实验分析方法等。技术路线强调以科学问题为主线，完成项目研究内容的流程、顺序、各项研究内容间的内在联系和步骤。技术路线在叙述研究过程的基础上，可采用流程图的方法来说明，具有一目了然的效果。实验手段、关键技术采用何种具体的实验方法、手段，在阐明实验基本原理的基础上，利用何种实验材料，测试何种物理、力学、化学等量，宜适当介绍。
可行性分析是指是否具备顺利地进行项目研究的环境和条件，一般包括：与项目相关的文献资料、实验设备、时间、经费、技术、学术信誉等方面的条件；已有的研究基础，特别是进行项目研究在学术上的可能性；项目主持人和项目组成员的知识结构、科学品格、兴趣爱好、献身精神、学术专长等。如果条件不具备，采用何种方法解决。当然，有好的想法也是相当重要的条件。
四、项目的特色与创新之处。围绕科学问题的提出在拟研究项目中的科学问题、研究内容、研究目标、研究方法或预期成果等方面的特色和在学术上的新颖性。通常可利用优先资助领域阐明项目研究特色。
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