系统论的基本范畴、基本原则、系统产生发展的条件和过程的理论,与笔者阐述的神与物质对立统一决定世界变化发展的哲学本体论和方法论相兼容。
一方面说明系统论具有强大生命力,正确反映了世界怎么样;另一方面说明笔者的二元论正确反映了世界深刻本质神与物质对立统一关系。一个是对世界现象或不甚深刻本质的正确反映,一个是对世界深刻本质的正确阐述,本质和现象是统一的,或者说深刻本质与不甚深刻本质是统一的。
系统论作为方法论,是对哲学方法论联系的观点、发展的观点的补充、完善、具体化,突出了世界万物的系统性。系统论没有涉及世界的本原,也就未涉及哲学的本体论。因此系统论并没有回答哲学的基本问题:精神与物质的关系问题。系统论不能代替哲学,哲学既是世界观又是方法论。系统论丰富和发展了方法论,是人类认识的飞跃。


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