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用ggplot2画火山图过程中,发现图像与结果不符

用ggplot2画火山图过程中,发现图像与结果不符

发布:a1357310425 | 分类:考研

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新手求助,在用ggplot2画基因差异火山图过程中,r出现如下错误:这是用ggplot2运行出来的图https://bbs.pinggu.org/forum.php?mod=image&aid=2351396&size=300x300&key=36d4950421308562&nocache=yes&type= ...
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新手求助,在用ggplot2画基因差异火山图过程中,r出现如下错误:这是用ggplot2运行出来的图
https://bbs.pinggu.org/forum.php?mod=image&aid=2351396&size=300x300&key=36d4950421308562&nocache=yes&type=fixnone
这是用volcano运行出来的图
https://bbs.pinggu.org/forum.php?mod=image&aid=2351395&size=300x300&key=c5f2b004817db4c0&nocache=yes&type=fixnone
但结果是错误的,求大神看看代码错在哪了,还有请问ggplot2作图能否把图像下面一些空白部分也补充上,谢谢。
代码如下:data <- read.table("05gene.foldchange.txt",header = T,sep="\t")
data$threshold <- as.factor(ifelse(data$adj.P.Val < 0.05 & data$logFC >1,ifelse(data$ adj.P.Val < 0.05 & data$logFC<(-1),"UP","Down"),"Not"))
请各位大神不吝指教,谢谢!
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