R语言相关系数矩阵参数设置

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感谢羊乖乖带给我们的问题，几种参数设置说明，在该帖子中都有：
相关系数计算中缺失值的处理问题
问题如下：当use=“complete.obs”时，空值的地方会被casewise deletion（ If use is "complete.obs" then missing values are handled by casewise deletion (and if there are no complete cases, that gives an error). ）但计算出来的相关系数矩阵是完整的没有缺失值的，那么那些空值的地方的值是用什么方法填补的呢？

有缺失值，是不填补的。以下图为例：

复制代码

1.如果是complete的情况，那么进行计算时，采用的是下列情况：

计算出来的相关系数

1. > cp
   
2.   x y  z
   
3. 1 1 3  4
   
4. 2 2 4  5
   
5. 3 5 8  9
   
6. 4 7 6 12
   
7. > zz
   
8.    x  y  z
   
9. 1  1  3  4
   
10. 2  2  4  5
    
11. 3  3 NA  6
    
12. 4  4  7 NA
    
13. 5  5  8  9
    
14. 6 NA NA 10
    
15. 7  6 NA 11
    
16. 8  7  6 12
    
17. > cor(zz,use="complete.obs")
    
18.           x         y         z
    
19. x 1.0000000 0.7779078 0.9986590
    
20. y 0.7779078 1.0000000 0.7522874
    
21. z 0.9986590 0.7522874 1.0000000
    
22. > cor(cp)
    
23.           x         y         z
    
24. x 1.0000000 0.7779078 0.9986590
    
25. y 0.7779078 1.0000000 0.7522874
    
26. z 0.9986590 0.7522874 1.0000000

复制代码

2.如果是pairwise.complete.obs，那么计算，对应的应该就是下列方式：

代码示例如下：

1. > cor(zz,use="pairwise.complete.obs")
   
2. x y z
   
3. x 1.0000000 0.7372609 0.9953212
   
4. y 0.7372609 1.0000000 0.7522874
   
5. z 0.9953212 0.7522874 1.0000000
   
6. >
   
7. > xy<-na.omit(zz[,1:2])
   
8. > xy
   
9.    x y
   
10. 1 1 3
    
11. 2 2 4
    
12. 4 4 7
    
13. 5 5 8
    
14. 8 7 6
    
15. > cor(xy)
    
16. x y
    
17. x 1.0000000 0.7372609
    
18. y 0.7372609 1.0000000

复制代码

计算结果是一样的，说明理解没错。
嗯，就这么多了，欢迎讨论！

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关键词：相关系数矩阵 相关系数 参数设置 R语言 Complete values error

受教了 原来是我理解的不对。。谢谢~~

困扰许久了，豁然开朗。谢谢分享！

原来如此，感谢解释

见到有use='na.or.complete'的什么意思呢？ complete？

感谢分享！

Luove 发表于 2018-2-1 23:29
见到有use='na.or.complete'的什么意思呢？ complete？

来源：https://www.douban.com/note/725123309/
“complet.obs”是以删除包含缺失值个案的方法来处理缺失，有一条数据有缺失，那么这一整条都会被删掉。如果每一条数据都有缺失值的话，那么系统最后就会返回ERROR。
“na.or.complete”这个方法对于缺失值是和“complet.obs”是一样的，都是删除含有缺失值的个案。区别在于如果每条数据都不完整，此方法是返回NA而不是ERROR

好贴字数补丁