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北京交通大学理学院成立于1998年8月，目前涵盖了数学、物理、化学、生物四个一级学科，现下设3系3所――数学系、物理系、化学系、光电子技术研究所、生命科学与生物工程研究院、激光研究所，拥有光学工程一级学科博士点，和光学、运筹学与控制论2个二级学科博士点，有数学、物理学、光学工程3个一级学科硕士学位点，以及15个二级学科硕士学位点，并设有光信息科学与技术、信息与计算科学、材料化学3个本科专业。此外还招收理科实验班――思源班。除了承担大量的基础和专业教学工作外，还开展广泛的科学研究。

现拥有国家级物理实验教学示范中心、国家工科物理教学优秀实验基地；“发光与光信息技术”教育部重点实验室，“信息存储、材料与显示”铁道部开放实验室；以及3个专业实验室：光信息科学与技术实验室，化学实验室，信息与计算科学实验室，和全面建设的生物科学与技术实验室。 实验室面积5000ｍ2 ，设备资产近4500万 。

理学院自成立以来，始终坚持以学科建设为龙头，以师资队伍建设为核心，以条件建设为支撑，以制度建设为保障，不断深化改革，在师资队伍建设、学科建设、教学研究、人才培养、科学研究等方面取得了长足的进步。

2010年学院现有教职工199人，教师165 人，拥有中国科学院院士徐叙